Huuliharppu on syytä puhdistaa säännöllisin väliajoin. Vaikka soittaja kuinka puhdistaisi suunsa ennen soittoa niin soittimeen kertyy pakostikin vähitellen esimerkiksi kuollutta ihoa. Puhdistuksen ajaksi huuliharppu kannattaa purkaa osiksi, jotta kaikki lika irtoaa soittimesta. Tämä onnistuu helposti. Puhdistukseen tarvitset astianpesuainetta, hammasharjan, ruuvimeisselin (ristipäisen + ehkä talttapäisen riippuen huuliharppumallista).

Nämä ohjeet eivät ole pätevia jos kyseessä on niiteillä kiinnitetyt kuoret esim. Hohnerin malli ”Marine Band Classic”.

1. Irrota huuliharpun ulkokuoret käyttämällä joko risti- tai talttapäistä ruuvimeisseliä.
2. Irrota kielilaata kammasta käyttämällä risti- tai talttapäistä ruuvimeisseliä (useimmiten ristipää).
3. Sekoita astianpesuainetta veteen samassa suhteessa kuin tiskatessasi.
4. Laita huuliharpun metalliosat likoamaan muutamaksi minuutiksi pesuveteen. Älä laita sinne puisia osia. Ruuveja ei välttämättä tarvitse laittaa likoamaa, jos ne eivät ole silminnähtävästi keränneet likaa.
5. Ota metalliosat pesuvedestä ja puhdista hammasharjalla. Kielilaattoja puhdistaessa harjaa kielten suuntaisesti eli juuresta kärkeä kohti. Älä poikittain suhteessa kieliin tai ”vastakarvaan”. Puhdista myös puuosat hammasharjalla.
6. Huuhtele pesuvesi pois vedellä.
7. Annan osien kuivua ilmavassa paikassa.
8. Osien kuivuttua kunnolla kokoa huuliharppu taas soittokuntoon.